Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms