Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC3AP31941 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms