Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms