Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD247P20963 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD247P20963 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD247P20963 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD247P20963 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms