Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SMIM1B2RUZ4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms