Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CFAP73A6NFT4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms