Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP36Q9P275 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms