Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASS4Q9NQ75 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms