Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOPXQ9BPY8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOPXQ9BPY8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms