Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms