Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX21Q969T3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX21Q969T3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX21Q969T3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms