Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ME3Q16798 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ME3Q16798 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME3Q16798 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME3Q16798 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME3Q16798 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME3Q16798 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME3Q16798 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ME3Q16798 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ME3Q16798 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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