Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms