Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms