Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK5Q00535 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms