Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ETV1P50549 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms