Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GGCXP38435 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGCXP38435 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGCXP38435 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGCXP38435 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms