Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTR2CP28335 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2CP28335 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2CP28335 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2CP28335 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2CP28335 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2CP28335 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2CP28335 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2CP28335 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2CP28335 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTR2CP28335 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms