Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms