Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGAP02671 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGAP02671 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGAP02671 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGAP02671 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGAP02671 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGAP02671 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGAP02671 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGAP02671 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGAP02671 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGAP02671 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGAP02671 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGAP02671 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGAP02671 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGAP02671 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms