Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APAF1O14727 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APAF1O14727 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APAF1O14727 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APAF1O14727 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APAF1O14727 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APAF1O14727 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APAF1O14727 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APAF1O14727 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms