Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RGPD3A6NKT7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD3A6NKT7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms