Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms