Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUX4Q9UBX2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms