Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms