Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRIP1Q9BX63 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRIP1Q9BX63 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms