Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Slc43a2Q8CGA3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc43a2Q8CGA3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms