Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q66JV7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q66JV7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q66JV7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q66JV7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q66JV7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q66JV7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q66JV7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q66JV7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q66JV7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms