Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6899Q3USS0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms