Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITSN1Q15811 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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