Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SEC23BQ15437 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SEC23BQ15437 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SEC23BQ15437 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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