Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD1Q15116 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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