Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCF4Q15080 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCF4Q15080 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms