Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms