Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
STRN3Q13033 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms