Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrig1P70193 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrig1P70193 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms