Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCE1P61221 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms