Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rin3P59729 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms