Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGER2P43116 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGER2P43116 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms