Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sept1P42209 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms