Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TSPOP30536 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TSPOP30536 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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