Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms