Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO1P25800 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO1P25800 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO1P25800 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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