Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM21P19474 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms