Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM27P14373 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms