Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRDCB7Z8K6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms