Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm27029A2A4P4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms