Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF2Q9Y5W3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms