Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO40Q9UH90 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms