Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CFDP1Q9UEE9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFDP1Q9UEE9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms